秋天

快要升级成“送机王”了!

白师兄终于要飞UCSD了,他是lucky的,六年的时间,算是正常毕业了,还有一篇好文章在手,努力终不白费。他是个非常有计划和自制力的人,积极的思考,为人又诚恳又勤勉,尽管大我两岁,但是,还是觉得相比之下我简直太懒散自任了。还想着表面上诗意的生活,自由的精神,superficial,这就是我到现在还在为论文为毕业而劳烦的原因吧。

大院里的桂花飘香了,沁人心脾的香味散落在秋气浓郁的阳光里,方佛能抓握到手中,仔细嗅个够。天是高远的,湛蓝而点染着白云,就要让人停住心跳一般,摄人心魄。如果能停住一刻,我想化作一片葉,哪怕是一片羽毛,轻轻的在这秋日的阳光下小小的暖懶的风里飘舞。

Violet-紫 Comment Trackbacks (0) 10/17 2007, 00:02 Edit

重组以及筛选

着上次的再写点吧,毕竟这样可以帮助整理一下自己的思路。

发现virus可以把相关的基因带入染色体并可以稳定遗传给下一代,这对ES种质性的modification是个big good news。但是,还是要解决一些关于基因整合的特异性问题。如果引入的外源基因是randomly insertion,那就是transgenic技术,应用非常有限并且可能存在非常多的uncertainty。比如可能导致正常染色体区域的中断,这些都是实现应用的重大问题。

这个时候,另外两位诺贝尔奖获得者的工作重要性就出来了。 Capecchi以及Oliver Smithies非常重要的贡献就是解决了特异性的基因修饰的问题。这时,之前在细菌里得到的基因重组的理论显示其powerful的aspect。下面会讲到这一点。

so,科学的研究都是前仆后继的,听到的一个说法是,上帝因人类始祖犯罪把永生从他们身上夺去,但是人类依靠文明的传承将整个历史串联起来,似乎在另外一种意义上延续了生命。当然,这个说法有点突出人类为了得到智慧果而与God争斗的意味:)

1958年诺贝尔奖获得者Joshua Lederberg发现在bacteria里,存在一种很有意思的现象,一条染色体上的两个同源臂,可以在分裂的时候互相交换,就是发生了同源重组.(Homologous recombination)通俗的说,就是一条拉链的两边在拉动的时候,左边的部分被置换到右边.这样,一些基因信息就发生了交换,如果同源臂上的基因有不同,这样就有可能产生有意义的变异(mutation).这个原理后来人们发现也可以应用到真核生物里,就是高等的生物中也存在这样的现象.那么显然,如果要特异性的在某个染色体区段置换入一个基因,就必需知道置入区域两端的染色体组成,然后在被置入的基因两端也加上相同的组成,这样在重组酶的作用下,就会发生外源基因特异性的代换.

HR
 如上图示意,在染色体进一步复制过程中,蓝色部分被逐渐置换入绿色的区域.整个过程还是比较复杂的。但是具体应用起来,可以用下面的图来示意.

cross 

两边的橙色同源成分必须严格一致,这样含有外源基因的target vector在转入ES细胞后,经过重组,就可以把想要改造的基因进行置换了。

这样看上去已经完成了,但是在实际操作中,由于重组发生的效率以及转染可能存在的差异,必须有一个好的选择标记. 并且在选择压力存在之下,重组也才会更有效率.Capecchi以及Oliver Smithies首次在这个系统内用了neo以及tk的双重筛选。也就是,只有在新霉素正筛选以及胸腺嘧啶激酶的负筛选下,得到的克隆才是真正发生了重组有意义的克隆...

巴拉巴拉这么些,看得出科学工作的精妙以及繁琐细致了吧.到上面为止,真正的targetting技术才得到蓬勃的应用和发展,此后相继出现的conditional KO以及Knock in技术无非都是based on上面的进一步发展. 

Tsing-青 Comments (2) Trackbacks (0) 10/13 2007, 00:30 Edit

再谈诺奖

继续谈一下诺奖和KO。我看了一下网站上的advanced information,介绍了获奖的贡献、重要意义以及起始来由。主要看来是Martin Evans最初发展这个技术,然而百年之前人们就意识到动物体内分化的细胞以及组织来源于未分化的干细胞。这一点我是相当佩服的,在seeing is believing之前就有超前的石破天惊的类似于“哲学式”的推想,这些都是象星辰一样天才级的人物。记得上神经生物学基础课的时候,老师总是要提到神经生物学鼻祖式的人物----Cajal(也是Nobel的生理学奖获得者,see here)。 (More)

Blue-蓝 Comments (4) Trackbacks (0) 10/11 2007, 03:00 Edit

Nobel Prize of Physiology or Medicine

午就预报了诺奖生理医学奖的出炉时间,下午(准确说昨天)5点十分左右,果然公布了今年的winners,"for their discoveries of principles for introducing specific gene modifications in mice by the use of embryonic stem cells"。

我看到玄机bbs上有人不屑说,技术都能获奖了,诺贝尔现在“堕落”了,其实应该说,这个还是实至名归的。Gene targetting,如今改变了多少领域内的研究啊!尤其是in vivo水平的研究,是个重大的进步。直接将一个基因通过重组,注射到ES细胞里,然后生成Chimera既而得到纯合子,从而实现gene的KO或者导入,对研究一个基因的功能是相当重要的,当然结合现在的conditionla KO技术,会有更清晰的应用和阐明。再进一步说来,这个技术也是对传统的一个颠覆。任何gene在合适的条件下都可以transgenic进入mice里,说不定未来就生成了一个新的生物类型,古时候玄武麒麟等怪兽都不足为奇了。但我相信科学会在伦理许可的范围了进行,因为尽管如此,仍有许许多多的未知非人能控制,科学还是会谨慎的在影响小的范围内进行。

前些年我就在做一个课题,用这个技术,只是一个Gene targetting 的clone实在太复杂了,最终也没有成功。国内成功的也还很少,因为源于生命体上的改变,毕竟是非常complex的啊~

Nobel晚上看到opera有新的build出来,代号是9.5 alpha build 9500,采用了新的内核Kestrel,运行速度以及占用内存都得到非常之大的提高,远远超出IE以及firefox几条街。马上下来试用,结果果然如很多网友说的,在搜索栏里输入英文后转汉字输入,立马crash,对以前的feed支持也不好,折腾许久,还是等最终版吧:(

Tsing-青 Comment Trackbacks (0) 10/10 2007, 01:37 Edit

台风罗莎

10 1好容易就过去了,待回味都不得空闲。新work week的一天是从忘记闹铃响的迟到开始。不过庆幸还赶上了一场报告会。Wen-Hwa Lee和Eva Yue-Hwa Pan Lee作的,后面的一个名字有点怪,夹杂了中文名,英文名,夫姓。两位都是从台湾去美国的华人科学家,在一个并不是太出名的大学,University of California, Irvine---应该说是加州学校里比较不famous的分校了。但是贡献很不小,世界上第一个发现抑癌基因Rb,推动了大家对癌症起因的重大认识,在tumorgenesis领域翘楚,Cell都要主动向其约稿的大牛。夫人先讲,还是很温婉的;到后来伊先生报告,风格很不一样,幽默而气势磅礴,思路清晰,脉络分明,果真牛人也。号称自己经费有三四百万---“不是RMB!”,还呼唤感兴趣的去联系postdoc。倒也是,他们实验室很多中国人,但是我想,必定也是要勤力苦干,不容易混的。

继续在写论文重复实验。天气骤然冷起来了,台风的影响,风大雨狂。早晨单车还前轮爆胎!水雨中执只孤伞,遮不住的短袖衫着在身上有些瑟瑟。夜里也是雨,回去衣服尽都湿掉。---但,此刻家中的温暖,那窗口处透出来的灯,就象冰心的《小橘灯》里的故事。。。

台风的名字都很阴柔,但是外什么却是那么凶厉?下面好像还有个叫“杨柳”的,呵呵,俄娜多姿啊。

Tsing-青 Comments (1) Trackbacks (0) 10/10 2007, 00:45 Edit


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